La ciboulette est le seul Allium indigène à la fois de l'Ancien Monde et du Nouveau Monde. Son aire naturelle couvre l'Eurasie tempérée, de l'Oural au Kamtchatka, et, en Amérique du Nord, elle s'étend à travers l'Alaska, la majeure partie du Canada et une partie du nord des États-Unis. Les plants indigènes préfèrent les rives et les prés, tandis que les plants échappés des jardins apparaissent aussi dans les champs, en bord de route et sur les terrains vagues, ce qui rend difficile de distinguer les populations indigènes des populations introduites.
Le nom schoenoprasum vient de mots grecs signifiant jonc et poireau, et le mot anglais chive vient du français cive, issu du latin cepa, oignon. On pense que l'usage de la ciboulette remonte à 5 000 ans, et dans l'Europe médiévale, on la cultivait sous le nom de « poireau-jonc ». Les Autochtones d'Amérique utilisaient les bulbes et les feuilles pour parfumer le poisson, les soupes et les salades.